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DescriptionContexte : à compter de janvier 2025, l'UMRt BioEcoAgro de Boulogne sur mer sera porteur d'un projet FEAMPA : InovAQtion. Ce projet, portant sur la vibriose du bar Dicentrarchus labrax, regroupe différents partenaires universitaires et industriels. Dans le cadre de ce projet, les missions porteront plus spécifiquement sur l'étude de V. harveyi et de ses mécanismes de virulence notamment via des études transcriptomiques. Activités principales : - Choisir, développer et adapter les protocoles de préparation et d'analyse des échantillons biologiques. Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques liées à la microbiologie, la biologie moléculaire et le séquençage haut débit. - Mettre au point et optimiser les protocoles expérimentaux pour l'échantillonnage, la conservation, le traitement des échantillons biologiques - Adapter, développer et optimiser les protocoles d'étude des acides nucléiques et en particulier des ARN (RT-PCR, RT-qPCR et métatranscriptomiques (RNA-seq)). - Collecter, traiter, interpréter, exploiter et mettre en forme des données expérimentales tout en garantissant le suivi et la qualité - Mettre en œuvre une ou plusieurs techniques expérimentales conduisant à l'obtention de connaissances sur la présence de gènes de virulence ainsi que sur leur expression dans des environnements (biotiques et abiotiques) contrastés - Gérer et organiser les moyens techniques dans le cadre d'un projet scientifique : InovAQtion - Conduire l'appareillage dédié (en particulier séquenceur Haut débit Illumina) en assurer le fonctionnement et la maintenance. - Assurer l'application des principes et des règles d'hygiène et de sécurité - Assurer une veille scientifique et technique dans le domaine de la vibriose, des mécanismes de virulence, des études génomiques et transcriptomiques des Vibrions - Participer à la diffusion et à la valorisation des résultats sous formes de présentations orales et de publications Diplôme exigé : thèse de doctorat en Sciences de la vie Encadrement d'un personnel de catégorie A Conduite de projet Connaissance, savoir : - Biologie cellulaire, microbiologie, biologie moléculaire (connaissances approfondies) et séquençage haut-débit - Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité - Cadre légal et déontologique - Bio informatique, biostatistiques et informatique appliquée - Langue anglaise : B2 minimum (cadre européen commun de référence pour les langues) Savoir-faire : - Mettre en œuvre des techniques liées à la biologie cellulaire, à la microbiologie, la biologie moléculaire. - Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité de séquençage haut débit et au traitement bio informatique des données. - Concevoir et optimiser des dispositifs expérimentaux - Rédiger des documents scientifiques - Gérer les relations avec des interlocuteurs et les partenaires Savoir être : - Capacité de raisonnement analytique - Autonomie - Sens de l'organisation et de la priorisation des tâches - Sens relationnel
PROFIL SOUHAITÉ
Expérience
Savoir-être professionnels
- Faire preuve d'autonomie
- Organiser son travail selon les priorités et les objectifs
Formations
- Bac+5 et plus ou équivalents
Source: Pole emploi (https://www.pole-emploi.fr)